Noé, un homme juste et intègre, vit parmi une humanité corrompue et violente. Dieu, voyant la dégradation des habitants de la terre, décide de détruire toute vie. Il ordonne à Noé de construire une arche en bois de gôfèr : « Fais-toi une arche de bois de gôfèr ; tu distribueras cette arche en cellules, et tu l’enduiras, en dedans et en dehors, de poix.  Et voici comment tu la feras : trois cents coudées seront la longueur de l’arche ; cinquante coudées sa largeur, et trente coudées sa hauteur.  Tu donneras du jour à l’arche, que tu réduiras, vers le haut, à la largeur d’une coudée ; tu placeras la porte de l’arche sur le côté. Tu la composeras d’une charpente inférieure, d’une seconde et d’une troisième. » (Genèse 1 ; 14-16), afin de sauver sa famille et chaque espèce animale. Noé obéit, rassemble sa famille et un couple de chaque espèce animale pour les protéger du déluge qui va s’abattre.

Le déluge dure quarante jours et quarante nuits : « … et j’effacerai de la surface du sol tous les êtres que j’ai créés. » (Genèse 7 ; 4). Les eaux montent, couvrant les montagnes. Noé, ses proches et les animaux survivent dans l’arche. Après cent cinquante jours, les eaux commencent à diminuer, et l’arche s’arrête sur les montagnes d’Ararat. Noé envoie un corbeau, puis une colombe, pour vérifier si la terre est sèche. Lorsque la colombe revient avec une feuille d’olivier, Noé comprend que les eaux ont baissé.

Finalement, Dieu dit à Noé de sortir de l’arche avec sa famille et les animaux. Noé offre des sacrifices en reconnaissance, et Dieu établit une alliance avec lui : « Je confirmerai mon alliance avec vous nulle chair, désormais, ne périra par les eaux du déluge ; nul déluge, désormais, ne désolera la terre. » (Genèse 9 ; 7).  Dieu bénit Noé et ses fils, leur demande de se multiplier et de remplir la terre. Il leur donne la domination sur tous les animaux et leur permet de les manger, à condition de ne pas consommer leur sang.

Plus tard, Noé plante une vigne, et après en avoir bu, il s’enivre et se dénude. Cham, l’un de ses fils, voit la nudité de son père et en informe ses frères, Sem et Japhet, qui couvrent leur père sans le regarder. A son réveil, Noé maudit Canaan, fils de Cham : « Maudit soit Canaan ! Qu’il soit l’esclave des esclaves de ses frères ! Il ajouta : « Soit béni l’Éternel, divinité de Sem et que Canaan soit leur esclave, que Dieu agrandisse Japhet ! » (Genèse 9 ; 25-27).

Les descendants de Noé se dispersent et peuplent la terre. Plus tard, les hommes décident de construire une tour pour atteindre le ciel. Dieu, voyant leur arrogance, confond leur langage afin qu’ils ne puissent plus se comprendre, et les disperse sur toute la surface de la terre. La ville est appelée Babel.